ถ้ำมัจฉา อยู่ห่างจากที่ทำการอุทยานแห่งชาติเขาปู่-เขาย่า ประมาณ 2 กิโลเมตร เป็นถ้ำน้ำขนาดกลางมีห้องโถงใหญ่ถึงสามห้อง ภายในถ้ำมีหินงอก หินย้อย มีแอ่งน้ำกว้างประมาณ 200 เมตร มีฝูงปลามัดอาศัยอยู่เป็นจำนวนมาก นอกจากปลา ถ้ำนี้ยังเป็นที่อาศัยของค้างคาวหลายประเภท อาทิ ค้างคาวหน้ายักษ์ และค้างคาวมงกุฎ เป็นต้น